本专业自2012年设置，交通工程专业依托南京理工大学自动化学院交通工程系的优质资源，设置轨道交通运营管理方向。目前在校学生超200人。培养具备交通工程和系统规划、设计与控制等方面知识，能在公路、铁路、轨道等交通工程领域内从事交通规划、设计、建设及运营管理等方面的工程技术应用型人才。