我校制药工程专业于2001年获批组建，2002年起正式招生。2005年获得“药物化学”二级学科硕士授予权，2010年获得“药学”一级学科硕士授予权。2013年制药工程专业进入省内一本招生。2016年成为学校首批“113”人才培养体系建设的试点专业。2018年通过国家教育部工程认证。2019年获批为辽宁省双一流专业。目前，依托于制药工程专业建有辽宁省制药化工过程工程技术研究中心、辽宁省创新团队和辽宁省大学生校外实践基地等多个省级科研和教学平台。
　　培养目标：面向现代制药行业及其相关领域经济建设发展的需求，培养具有良好的人文社会科学素养和职业道德，具备自然科学、工程技术科学及制药工程理论基础，能够在制药及其他相关领域进行技术与生产管理、工艺与工程设计、质量管理与控制等工作的工程应用型技术人才。
　　主要课程：药物化学、药理学、药物分析、药剂学、制药工艺学、药物合成反应等。
就业：（1）国内大中型制药企业的药品生产与管理、质量管理与控制、工艺与工程设计和研发等工作；
（2）医院制剂、质检和临床药学等工作；
（3）药店药师和医药公司药品流通及国内外贸易等工作；
（4）药品监督局药品质量监督等工作。
（5）报考药学、制药工程及相关专业的硕士研究生。