基础医学和临床医学的侧重点不同，一个是研究基础学科如解剖、生理、生化、微生物等等学术性内容，临床医学是以内外妇儿、五官科、眼科、皮肤科等等临床应用学科的内容。
基础医学和临床医学的区别
基础医学专业培养具备自然科学、生命科学和医学科学基本理论知识和实验技能，能够在高等医学院校和医学科研机构等部门从事基础医学各学科的教学、科学研究及基础与临床相结合的医学实验研究工作的医学高级专门人才。
基础医学属于一级学科，主要是生物学和基础医学。基础医学主要课程有医学生物数、 医学生物化学、 医学生物物理学、 人体解剖学、 医学细胞生物学、 人体生理学、 人体组织学、 人体胚胎学、医学遗传学、 人体免疫学 、 医学寄生虫学、 医学微生物学、 医学病毒学、 人体病理学、 病理生理学、 药理学、 医学实验动物学、 医学心理学、 生物医学工程学、 医学信息学、 急救学、护病学等。
临床医学除了要学习以上的课程之外，还要学习包括： 临床诊断学、 实验诊断学、影像诊断学、 放射诊断学、超声诊断学、 核医诊断学、 临床治疗学 、职能治疗学、 化学治疗学 、生物治疗学、 血液治疗学、 组织器官治疗学 、饮食治疗学、 物理治疗学、 语言治疗学、 心理治疗学、内科学、 外科学、 泌尿科学 、妇产科学、 儿科学 、老年病学、 眼科学、 耳鼻喉科学、 口腔医学、 传染病学、 皮肤医学、 神经医学、精神病学、 肿瘤医学、 急诊医学、 麻醉学、 护理学，家庭医学、 性医学、 临终关怀学、 康复医学、 保健医学、 听力学等。
临床医学是研究疾病的病因、诊断、治疗和预后，提高临床治疗水平，促进人体健康的科学。它根据病人的临床表现，从整体出发结合研究疾病的病因、发病机理和病理过程，进而确定诊断，通过预防和治疗以最大程度上减弱疾病、减轻病人痛苦、恢复病人健康、保护劳动力。临床医学是直接面对疾病、病人，对病人直接实施治疗的科学。
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