平行志愿考生多次检索机会，一次投档机会；顺序志愿考生多次检索机会，多次投档机会。平行志愿分数优先，以考生为维度进行排序；顺序志愿志愿优先，以院校为维度进行排序。平行志愿都是第一志愿，梯度较小；顺序志愿梯度较大。
顺序志愿投档原则是“按照志愿从高分到低分投档”，而平行志愿投档基本原则是“按分排序，遵循志愿”。平行志愿录取办法每批次只设置一个平行院校志愿、一个征求平行院校志愿及院校服从志愿。顺序志愿每批次设置第一至第四志愿及服从志愿。
平行志愿更注重保护高分考生的录取率，而顺序志愿更注重保护考生的专业满意度。
平行志愿的投档方式是“分数优先，遵循志愿”，就是把全省考生，分“文科”和“理科”两种类别，按照成绩由高到低进行排序，分数越高，越先被投档。
顺序志愿就是按“志愿+分数”的方式投档，在同一批次的录取中，省招生部门会把所有考生的档案，投到考生同一顺序志愿各自所报的院校进行录取，最后没有被录取的考生的档案，则退回到省招办，待第一志愿录取结束以后，省招办进行第二志愿的投档录取，以此类推。
平行志愿中，同一批次所报的各院校均为第一志愿，所以平行志愿没有“院校级差”的存在。而顺序志愿在同一批次所报的各院校分第一志愿，第二志愿.......等等。很多院校会设置院校级差，更有甚者，不录取非第一志愿考生。
在平行志愿中，考生可以报ABCDE五所院校，对于院校方来说，是不可能知道考生具体在ABCDE中的哪一个志愿报的自己学校。而在顺序志愿模式中，院校方是非常清楚，考生具体在第几志愿报的自己院校。
平行志愿模式中，考生一旦被退档，就只能参加本批次的征集志愿，或下批次的投档录取，但在顺序志愿中，考生同一批次的第一志愿被退档还可以继续参加第二志愿所报院校的录取。所以，平行志愿模式一旦被退档，后果比顺序志愿被退档的后果更严重。
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