独立学院与民办高校的区别是：办学层次不同、办学的主体不同、学校名称区别。
独立学院与民办学院的不同
独立学院是本科，而民办学院是本科、专科都有。独立学院是按照教育部行政规章设立的，而民办学院是按照民办教育促进法设立的。
民办学院有自己的校名、组织机构、师资力量和自己独立颁发的毕业证书。但是独立学院一般都是在某个大学名下设立的。可能会和挂名大学在同一个校园，也可能在师资量方面有共享，这是民办学院没有的优势。
独立学院毕业时，如果成绩好的学生可以推荐使用挂名院校的毕业证书，但是毕业证书上可能会略有差别。但是民办学院会有自己的毕业证书。
独立学院因为不是公办院校，所以一般学费都会比较贵，基本学费都在一万以上，独立院校大多是在本科三批招生，但是现在在很多省市都合并到本科二批招生了。
独立学院与民办学院哪个好
传统意识认为，独立学院是挂靠在名牌大学之下，自然质量要比民办大学高，实际上这点也不能一概而论。在笔者研究的过程中，近九成的独立学院都有受到母体大学师资、学科上面的支持，但也有部分学院的师资不甚理想。反观很多民办学校则是通过灵活的机制、资金投入，聚合了优秀的师资和学科资源。
事实上国家一直以来都是在鼓励独立学院真正脱钩母体，很多独立学院也都在做出决定或将此提上日程，但如果真正脱钩很多独立学院的教育质量将会有明显下滑。这是非常矛盾的一点，也是学生在择校时需要考虑到的风险。
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